女性生殖系统包含内生殖器和外生殖器。外阴及其结构形成外生殖器。内生殖器包含三部分导管系统：输卵管、子宫和阴道。这个导管系统连接到卵巢——主要的生殖器官。卵巢产生卵子并将其释放完成受精。受精卵在子宫内发育。
卵巢是两个杏仁状的结构，位于子宫的两侧，连接到输卵管。它们产生卵母细胞（卵细胞）以及雌激素、孕激素和其他激素。卵细胞的产生（也称卵子发生）始于原始卵泡。当女孩进入青春期时，每个卵巢都包含成千上万个卵泡，每个卵泡中都有一个初级卵母细胞。卵泡成熟时，一些初级卵母细胞变成次级卵母细胞。到排卵时，只会剩下一个成熟卵泡。其他卵泡退化。排卵期间（大约每月一次），优势卵泡破裂并释放其次级卵母细胞。卵母细胞进入输卵管，可在这里受精。
输卵管将卵巢连接至子宫。每个管的管壁具有外部的浆膜层、中间的肌层和内部的粘膜层，延续至子宫内膜。每个输卵管可分为三个部分：漏斗向腹部开口。称为峡部的狭窄部分与子宫相连。最后是盘曲在卵巢上的中间扩大部（壶腹）。卵子受精通常发生在输卵管壶腹部。然后卵子穿过峡部进入子宫。
子宫是一个中空的器官，位于膀胱和直肠之间的盆腔内。它是一个有着厚实肌肉壁的中空器官。输卵管通向子宫上部（每侧一条）。子宫下部缩窄成被称为子宫颈的部分，其通向阴道。月经期间，子宫内膜脱落。但是，当妇女怀孕时，受精卵会自己嵌入到子宫壁，从而防止月经。随着卵细胞发育成胚胎，然后发育成胎儿，子宫急剧扩张。
阴道从子宫最下方的子宫颈向下延伸到前庭，是外阴和外生殖器的一部分。它位于膀胱后面，直肠前面。内层粘膜衬在阴道的平滑肌壁上。和输卵管内层一样，这层膜延伸至子宫内膜。阴道有三个核心功能：让月经流出体外，性交时容纳男性阴茎，并作为分娩时的产道。
外阴的结构实现了性交，并提供了内生殖器的入口和出口。它们包括小阴唇和大阴唇、阴阜，阴蒂、前庭大腺和阴道前庭。前庭包括两个开口：较小的尿道口可让尿液排出（作为泌尿系统的一部分）。较大的阴道口是阴道的入口。
